Le 17 octobre, l'armée suédoise a soudainement commencé des recherches de grande ampleur d'un « sous-marin étranger » dans les eaux proches de la capitale Stockholm ; selon certains médias, la raison de cette opération serait l'« intrusion d'un sous-marin russe dans les eaux suédoises ». L'attitude de la Suède, qui consiste à ne « ni admettre ni démentir » n'a fait que renforcer les soupçons sur ce point. Quant au porte-parole du Ministère russe de la défense, il a déclaré dans un communiqué publié le 19 octobre que les missions des sous-marins de sa marine se déroulent comme prévu dans les eaux des différents océans du monde, et qu'aucun aucun accident ni cas d'urgence ne s'est produit.
Le site rusnews.com a rapporté le 19 octobre que l'armée suédoise a publié un communiqué sur son site internet disant que « Nous sommes actuellement en train de procéder à une opération de recherche dans la zone de l'archipel de Stockholm avec des navires équipés d'instruments de contrôle optiques et des dispositifs de détection de haute précision. Son objectif consiste à vérifier s'il y a ou non une activité sous-marine ici ». De son côté, le quotidien suédois Svenska Dagbladet a récemment cité des sources selon lesquelles la marine suédoise a intercepté le 17 octobre des signaux envoyés par la marine russe sur une fréquence radio utilisée dans les situations d'urgence, que l'émetteur se trouvait près de l'archipel de Stockholm, que et le récepteur se situait à Kaliningrad, en Russie. Un peu plus tard, l'armée suédoise a intercepté une communication cryptée. L'armée suédoise pense que cette émission pourrait émaner d'un sous-marin étranger se trouvant dans les eaux suédoises.
En 2000, le sous-marin nucléaire russe « Koursk » a coulé suite à une explosion lors d'un exercice, avec 118 membres d'équipage à bord. D'après certains médias étrangers, la station de radio russe Ekho Moskvy aurait mentionné le 19 octobre des sources qui proviendraient de l'état-major russe, et selon lesquelles « il n'y a pas eu de nouvelle version de l'incident du sous-marin 'Koursk', aucun sous-marin n'a coulé » dit-il, ajoutant que ce n'est pas la première fois que les médias occidentaux accusent la Russie, et que cette histoire d'accident d'un sous-marin russe dans les eaux suédoises est sans fondement et stupide. De son côté, le journal russe Novaya Gazeta a annoncé le 19 octobre que selon un haut responsable du commandement de la flotte russe du Nord, les sous-marins de ladite flotte du Nord sont tous stationnés dans les eaux de leur propre pays, ajoutant que par ailleurs les sous-marins nucléaires russes ne peuvent absolument pas s'engager dans les eaux de la mer Baltique pour y mener des exercices, car elles sont trop peu profondes.