D'après le Daily Mail, une lettre de 21 pages d'un haut conseiller, découverte dans le complexe d'Abbottabad, au Pakistan, où les SEALs de l'US Navy tuèrent Ben Laden en mai 2011, avait mis celui-ci en garde au sujet de l'Etat islamique en Irak et au Levant (EIIL), cette organisation étant jugée trop extrémiste, même pour Al-Qaïda, et il avait été conseillé à l'ancien dirigeant terroriste de rompre ses liens avec elle.
Le courrier précisait aussi que le mépris de l'EIIL pour les civils pourrait nuire à la réputation d'Al-Qaïda. L'article n'a cependant ni identifié le conseiller ni fourni la moindre citation directe de la lettre. Ce conseiller y qualifie néanmoins les techniques de l'EIIL comme barbares, comme son bombardement de mosquées, son utilisation de gaz de chlore comme arme et un massacre dans une église catholique de Bagdad.
Bien qu'il soit difficile de savoir quand Al-Qaïda a commencé à prendre ses distances avec l'EIIL, le commandement central d'Al-Qaïda a déclaré plus tôt cette année qu'il n'avait aucun lien avec le groupe. Selon une déclaration d'Al-Qaïda rapportée par le Los Angeles Times en février, l'EIIL « n'est pas une branche d'Al-Qaïda » et a « aucun lien organisationnel » avec Al-Qaïda.